洁净室，主要是控制在其内生产的产品所接触的空气的洁净度、湿度等各项指标符合标准，使产品能在一个具有良好条件和高度稳定性的环境空间中生产制造。
洁净室污染源主要有两大类：室内灰尘和化学物质。
1、室内灰尘
洁净室的灰尘大部分都不是从外部带入，而是从内部产生。空气中的灰尘主要由设备运转、生产过程、人员因素产生，这3种途径共计产生了85%的灰尘。
洁净室关于灰尘的原则包括4条：不将灰尘带入，不让灰尘产生，不让灰尘堆积，迅速排除灰尘。因此，洁净室内，对作业人员的洁净服装，对带入的工具、材料等，对于设备的清理和通风都要严格的要求。
洁净室过滤灰尘的仪器主要有高效空气过滤器（High Efficiency Particulate Air Filter，简称HEPA），超高效空气过滤器（Ultra Low Penetration Air Filter，简称ULPA）。
HEPA它对直径为0.3微米（头发直径的1/200）以上的微粒去除效率可达到99.7%以上，是烟雾、灰尘以及细菌等污染物最有效的过滤媒介，而ULPA对于直径0.15微米以上的微粒去除效率达到99.999%以上。
高效过滤器系列产品用超细玻璃纤维纸作滤料，出厂经过SX-H1050高效过滤器扫描测试台严格测试，具有过滤效率高、阻力低、容尘量大、风速均匀的特点，广泛应用于各种局部净化设备和洁净厂房在常温、常湿、常压条件下环境空气的净化。
化学物质：
除了灰尘以外，化学物质也是洁净室需要重点考虑和去除的。化学物质主要分为酸性物质、碱性物质、有机物、掺杂性气体等，主要来源为大气、生产中使用的化学用品、建材等。
尤其是在药厂洁净室，因为制品在车间生产过程中要使用大量的化学物质，而杂质化学物质很容易和生产用化学物质产生反应，影响产品质量，故化学物质的去除同样是洁净室需要重点考虑的一个方面。
对此，洁净室控制污染源的途径主要有3种：1、控制污染源，减少污染发生量；2、迅速排出室内已经发生的污染；3、有效阻止室外的污染侵入。
洁净室可以利用风向和风速来控制室内污染源，而在各个送风口就需要用到过滤器，首先要保证外界的污染源不能进入洁净室内。其次，对于每一个使用的过滤器，还需要检测其自身的洁净度是否符合洁净等级标准，这就需要对过滤器完整性进行测试。高效过滤器完整性测试仪，又称高效风口检漏仪，是洁净室（区）高效风口扫描检漏的专用仪器，通过实际扫描检测高效风口下游漏点值并跟计算的漏点值进行比较，实现对高效风口的检漏。
洁净室的洁净环境是一个动态持续的过程，并不是做好哪一方面就能够完全使洁净室环境度达到洁净标准的。从操作人员的服装，到进入洁净室需要的风淋室，以及对洁净室内粒子检测、湿度、风速等等指标，都需要做到实时多点在线监测，以保证日常生产运行。
